De nombreux biocombustibles découlent de la sylviculture, de l’industrie agroalimentaire et de l’agriculture. Tout comme la forêt, les exploitations maraichères et agricoles, utilisent comme principal source d’énergie le soleil qui induit la photosynthèse d’où absorption de CO2 de l’atmosphère.

Les arbres fruitiers tels que les noisetiers, les noyers, les amandiers produisent des coques qui protègent les fruits. Ces fruits sont écossés industriellement pour être consommés. Les coquilles récupérées possèdent des caractéristiques particulières ; elles peuvent servir par exemple d’abrasif pour nettoyer les fours industriels mais elles servent aussi directement comme biocombustible dans des chaudières industrielles.

Un autre exemple d’utilisation de valorisation :
La cerise, l’abricot, l’olivier sont des fruits à noyau. La fabrication de confiture, de glace ou d’huile, requiert la pulpe. Les noyaux de ces fruits sont alors utilisés comme biocombustibles industriels.